Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trerf1Q8BXJ2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trerf1Q8BXJ2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trerf1Q8BXJ2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trerf1Q8BXJ2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trerf1Q8BXJ2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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