Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Fbxo38Q8BMI0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Fbxo38Q8BMI0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Fbxo38Q8BMI0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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