Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms