Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Atg2bQ80XK6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Atg2bQ80XK6 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Atg2bQ80XK6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Atg2bQ80XK6 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Atg2bQ80XK6 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Atg2bQ80XK6 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Atg2bQ80XK6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms