Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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