Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Zbed4Q80WQ9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Zbed4Q80WQ9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Zbed4Q80WQ9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Zbed4Q80WQ9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Zbed4Q80WQ9 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms