Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rims3Q80U57 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms