Protein–RNA interactions for Protein: Q80TR4

Slit1, Slit homolog 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit1Q80TR4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slit1Q80TR4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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