Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna12Q80SS5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms