Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Clec18aQ7TSQ1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Clec18aQ7TSQ1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Clec18aQ7TSQ1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Clec18aQ7TSQ1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Clec18aQ7TSQ1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clec18aQ7TSQ1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms