Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shq1Q7TMX5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms