Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms