Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trim37Q6PCX9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trim37Q6PCX9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trim37Q6PCX9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trim37Q6PCX9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trim37Q6PCX9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trim37Q6PCX9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trim37Q6PCX9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trim37Q6PCX9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trim37Q6PCX9 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trim37Q6PCX9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trim37Q6PCX9 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim37Q6PCX9 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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