Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms