Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms