Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
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