Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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