Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atg9aQ68FE2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9aQ68FE2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg9aQ68FE2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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