Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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PtprdQ64487 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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PtprdQ64487 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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PtprdQ64487 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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PtprdQ64487 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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PtprdQ64487 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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PtprdQ64487 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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PtprdQ64487 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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PtprdQ64487 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PtprdQ64487 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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