Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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