Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde3bQ61409 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde3bQ61409 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms