Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ift88Q61371 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift88Q61371 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms