Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BcanQ61361 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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