Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cln3Q61124 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Cln3Q61124 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms