Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TmpoQ61033 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TmpoQ61033 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TmpoQ61033 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TmpoQ61033 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TmpoQ61033 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TmpoQ61033 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TmpoQ61033 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TmpoQ61033 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TmpoQ61033 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TmpoQ61033 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TmpoQ61033 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TmpoQ61033 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TmpoQ61033 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TmpoQ61033 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TmpoQ61033 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms