Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Klf3Q60980 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms