Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms