Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sin3aQ60520 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms