Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rbm27Q5SFM8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rbm27Q5SFM8 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rbm27Q5SFM8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm27Q5SFM8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms