Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Fam208bQ5DTT3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms