Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trp53i11Q4QQM4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms