Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shank3Q4ACU6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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