Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zmat1Q3V0C1 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zmat1Q3V0C1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms