Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.5 ms