Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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