Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm28047Q3US59 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm28047Q3US59 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28047Q3US59 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm28047Q3US59 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms