Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Tmem253Q3UNB8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms