Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Nkx6-3Q3UHX8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Nkx6-3Q3UHX8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Nkx6-3Q3UHX8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Nkx6-3Q3UHX8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Nkx6-3Q3UHX8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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