Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms