Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Arfgef3Q3UGY8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms