Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Tctex1d2-202ENSMUST00000080316 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Gm42897-201ENSMUST00000201486 2112 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnf166Q3U9F6 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
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Rnf166Q3U9F6 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 AC116390.1-201ENSMUST00000227975 670 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Rnf166Q3U9F6 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Zfp983-201ENSMUST00000039726 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms