Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Q3U6N9 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Q3U6N9 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Q3U6N9 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Q3U6N9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Q3U6N9 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Q3U6N9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Q3U6N9 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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