Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ulk3Q3U3Q1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ulk3Q3U3Q1 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms