Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms