Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.8 ms