Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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