Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN3

Defb33, Beta-defensin 33, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb33Q30KN3 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb33Q30KN3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms