Protein–RNA interactions for Protein: Q2PFD7

Psd3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psd3Q2PFD7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psd3Q2PFD7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psd3Q2PFD7 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psd3Q2PFD7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psd3Q2PFD7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psd3Q2PFD7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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