Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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