Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc162pQ0VG85 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms